Il est préférable, la veille et le jour de l'irrigation, de mettre le système digestif au repos et éviter toutes fermentations en consommant :

• - riz + légumes cuits (sauf pomme-de-terre et choux) + fruits cuits (essentiellement pommes et poires)

• - poissons + légumes cuits + fruits cuits

La personne est allongée confortablement sur le dos, une serviette au niveau de la taille afin de préserver son intimité et le praticien introduit une canule rectale sur laquelle sont fixés deux tuyaux : un de 6 mm pour l'arrivée d'eau et un autre de 20 mm, pour la sortie de l'eau et des matières fécales.

Les canules, les raccords d'arrivée et d'évacuation sont à usage unique et donc jetés après utilisation.

La canule est reliée à un appareil qui assure la filtration de l'eau, sa régulation thermique et son débit.

Le praticien pratique des bains successifs en alternant remplissage d'eau, trempage du côlon et évacuation de l'eau et des matières sans aucune émanation mal odorante.

Les matières évacuées passent dans un tube éclairé, ce qui permet à la personne et au thérapeute de juger du niveau de l'intoxication du gros intestin.

L'irrigation est accompagnée d'un doux massage abdominal qui détend la personne, fait remonter l'eau du rectum jusqu'au caecum, et favorise les ondes de péristaltisme.

Il est préférable de boire de l'eau et des tisanes juste après la séance et de manger du riz blanc et des légumes cuits par la suite, afin d'éviter des fermentations. C'est pour cette même raison qu'il est recommandé le lendemain, de ne prendre ni viande, charcuterie, alcool et sucre.